涉谷站轉乘問題 - 東京

請問各位前輩
預計這次去東京要走一趟川越
因為住的地點在淺草，加上有老人家不愛轉乘
所以決定優先選擇搭法:
在淺草搭乘東京メトロ銀座線到達涉谷，然後轉搭東京メトロ副都心線到川越

從navitime查的時候
　　　淺草→→→涉谷→→→和光市→→→川越
現金　--------------------280円-------310円
ic卡　--------------------278円-------308円

從Yahoo JP查的時候
　　　淺草→→→涉谷→→→和光市→→→川越
現金　280円---------------310円----------
ic卡　586円------------------------------

費用和拿一日券可能在川越補310円我都查好了
但問題是在涉谷站轉乘的時候
從路線表上顯示，都是不用出站
就可以從3樓的銀座線換到地下5樓的副都心線
但我從構內圖看，不管怎樣都要出閘門啊？！
https://goo.gl/cukEQi

那麼，如果路線是從3F出站，到B2F再入站
這樣不會刷兩次上車嗎？

如果用西瓜卡搭車是表示
在涉谷出站時會扣淺草→涉谷278
到川越後就只會扣和光市→川越308了嗎?


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